13c-metabolic-flux｜AIスキル大辞典

このSkillでできること

✓検証済みの炭素原子マップとmfapyの同位体シミュレーションを用いて13C-MFAを実行する
✓MDV/MID、位置同位体異性体、並列トレーサー実験の標識データを解析する
✓制約付きマルチスタートフィッティングとフラックスプロファイル診断を行う
✓標識データが特定の経路フラックスを制約できるかを評価し、COBRAのFBAと区別する

使い方

STEP 1

炭素ネットワーク、原子対応、区画、定常状態の前提を確認する

STEP 2

各炭素入力の位置同位体分布、フラグメント割り当て、自然存在比補正、測定不確かさを準備する

STEP 3

フラックス単位、細胞外速度または相対フラックス基準、生物学的に妥当な上下限を指定する

STEP 4

不足情報がある場合は推測せず、入力テンプレートを準備してフィット結果の識別可能性を診断する

Skillのインストール

AIにこのSkillを追加してもらう

GitHub URLごとCodexやClaude Codeへ渡し、現在の環境に合う方法を判断してもらいます。

このGitHubリポジトリにあるSkillを確認し、現在の環境に適した方法でインストールしてください。
インストール後、正常に利用できることを確認し、基本的な使い方も簡潔に説明してください。

Repository:
https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills

手動でインストールする

README / SKILL.mdから機械抽出できたコマンドのみ表示しています。推測したコマンドではありません。

uv venv --python 3.11 .venv-mfa
uv pip install --python .venv-mfa/bin/python -r "$SKILL_DIR/assets/requirements.txt"

mkdir -p ~/.cursor/plugins/local
ln -s "$(pwd)" ~/.cursor/plugins/local/scientific-agent-skills

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git ~/.agents/skills/scientific-agent-skills   # user-level
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git .agents/skills/scientific-agent-skills      # project-level

uv pip install cisco-ai-skill-scanner
skill-scanner scan /path/to/skill --use-behavioral

このSkillを使うプロンプト例

Skill名を明示すると、意図したSkillを使わせやすくなります。自動発動型では必須とは限りません。

定常状態の13Cトレーシング測定、炭素原子マップ、トレーサー組成、測定誤差、フラックス制約を入力として、実行可能な細胞内フラックス、識別可能なフラックス、プロファイル診断を評価してください。不足している前提や入力は推測せず列挙してください。

出力例を見る

入力要件の確認、実行可能なフラックス推定、制約されたフラックスの識別結果、プロファイル診断、不足情報と解釈上の注意を含む報告。

安全性チェック

自動解析による参考情報です。Skillの安全性を保証するものではありません。

外部API通信検出あり

Shellコマンド実行明確な記述なし

ファイル読み取り明確な記述なし

ファイル書き込み明確な記述なし

ネットワークアクセス検出あり

認証情報明確な記述なし

検出根拠を見る

network: pin abc123def [large code block omitted]bash git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git ~/.agents/skills/scientific-agent-skills
network: kills/scientific-agent-skills # user-level git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git .agents/skills/scientific-agent-skills

13c-metabolic-flux

このSkillでできること

使い方

Skillのインストール

AIにこのSkillを追加してもらう

このSkillを使うプロンプト例

安全性チェック

関連Skill

13c-metabolic-flux

cordis-plugin-sofagent-evolve

harness-ceo